Julien Philippon, venu du Morvan s'installe à Fleys en 1868 comme bûcheron. Peu à peu il achète terres et vignes qui constituent encore aujoud'hui la quasi totalité du domaine. Julien Philippon, sur les conseils d'un vieux viticulteur et conseiller général Chablisien a été certainement le premier à planter le porte greffe 161-49 en 1936, vigne toujours en production sur le lieu dit "Les Monts de Milieu".

Depuis le domaine s'est transmis de père en fils. Le siège du domaine "Château de Fleys" est en réalité un pavillon de chasse datant de la fin du XVIIème siècle, ayant appartenu au seigneur de Pathenay, écuyer de Louis XIV.

Le "Château" a été acheté par André Philippon (petit fils de Julien Philippon) en 1988.

Aujourd'hui ce sont ses enfants qui ont repris l'exploitation.